<div dir="ltr"><div style="font-size:12pt;font-family:'Calibri';color:rgb(0,0,0)">
<div>Hi everyone,</div>
<div> </div>
<div>I’m trying registration in ITK of 3D ANALYZE brain images and seem to get 
lost in various registration components. As I’ve read in some papers, each 
component should be chosen taking into account the features of my particular 
task. But still it is very hard for me to choose the right ones. </div>
<div> </div>
<div>Now I’m using RegularStepGradientDescentOptimizer with 
MeanSquaresImageToImageMetric and LinearInterpolateImageFunction 
(NearestNeighbor interpolator seems to produce worse result, BSpline 
interpolator makes the program too slow). As for the metric, I’ve also tried 
NormalizedCorrelation metric and it produces almost the same result, but 
sometimes is slower. Current transform is AffineTransform. I’m sure my images 
are correct (downloaded from IBSR). But I’m not satisfied with the 
results.</div>
<div> </div>
<div>Could you please explain how to choose an optimizer, metric and 
interpolator?</div>
<div> </div>
<div>Thanks,<br>Denis</div></div></div>