<html xmlns:v="urn:schemas-microsoft-com:vml" xmlns:o="urn:schemas-microsoft-com:office:office" xmlns:w="urn:schemas-microsoft-com:office:word" xmlns:m="http://schemas.microsoft.com/office/2004/12/omml" xmlns="http://www.w3.org/TR/REC-html40">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<meta name="Generator" content="Microsoft Word 14 (filtered medium)">
<style><!--
/* Font Definitions */
@font-face
        {font-family:Vrinda;
        panose-1:2 11 5 2 4 2 4 2 2 3;}
@font-face
        {font-family:Vrinda;
        panose-1:2 11 5 2 4 2 4 2 2 3;}
@font-face
        {font-family:Calibri;
        panose-1:2 15 5 2 2 2 4 3 2 4;}
@font-face
        {font-family:Consolas;
        panose-1:2 11 6 9 2 2 4 3 2 4;}
/* Style Definitions */
p.MsoNormal, li.MsoNormal, div.MsoNormal
        {margin:0cm;
        margin-bottom:.0001pt;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
a:link, span.MsoHyperlink
        {mso-style-priority:99;
        color:blue;
        text-decoration:underline;}
a:visited, span.MsoHyperlinkFollowed
        {mso-style-priority:99;
        color:purple;
        text-decoration:underline;}
span.EmailStyle17
        {mso-style-type:personal-compose;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        color:windowtext;}
.MsoChpDefault
        {mso-style-type:export-only;
        font-family:"Calibri","sans-serif";
        mso-fareast-language:EN-US;}
@page WordSection1
        {size:612.0pt 792.0pt;
        margin:70.85pt 70.85pt 2.0cm 70.85pt;}
div.WordSection1
        {page:WordSection1;}
--></style><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapedefaults v:ext="edit" spidmax="1026" />
</xml><![endif]--><!--[if gte mso 9]><xml>
<o:shapelayout v:ext="edit">
<o:idmap v:ext="edit" data="1" />
</o:shapelayout></xml><![endif]-->
</head>
<body lang="DE" link="blue" vlink="purple">
<div class="WordSection1">
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">I am looking at the itk Software Guide to figure out how to implement this in Python. I have:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">        nccMetric = itk.<u>NormalizedCorrelationImageToImageMetric</u>.IF3IF3.New()</span><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">        nccMetric.SetTransform(itk.<u>IdentityTransform</u>.D3.New())</span><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">        nccMetric.SetInterpolator(itk.<u>NearestNeighborInterpolateImageFunction</u>.IF3D.New())</span><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas"><o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">        nccMetric.SetFixedImage(fixedImage)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">        nccMetric.SetMovingImage(movingImage)<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">which I believe works fine. I am getting stumped by the translation of this to Python:<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-indent:35.4pt;text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas">  # ITK software guide page 390<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-indent:35.4pt;text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas">  # C++ code: MetricType::TransformParametersType displacement( Dimension );<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">        displacement = nccMetric.??       
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black">After which
<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas;color:black"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal" style="text-indent:35.4pt;text-autospace:none"><span lang="EN-US" style="font-size:10.0pt;font-family:Consolas">value = nccMetric.GetValue( displacement )<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US">should work fine. Anybody knows this?<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:DE">Regards,<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:DE">Sven<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#1F497D;mso-fareast-language:DE"><o:p> </o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><b><span lang="EN-US" style="color:#365F91;mso-fareast-language:DE">Sven Prevrhal<o:p></o:p></span></b></p>
<p class="MsoNormal"><span lang="EN-US" style="color:#365F91;mso-fareast-language:DE">Philips Research<o:p></o:p></span></p>
<p class="MsoNormal"><o:p> </o:p></p>
</div>
<br>
<hr>
<font face="Arial" color="Gray" size="1">The information contained in this message may be confidential and legally protected under applicable law. The message is intended solely for the addressee(s). If you are not the intended recipient, you are hereby notified
 that any use, forwarding, dissemination, or reproduction of this message is strictly prohibited and may be unlawful. If you are not the intended recipient, please contact the sender by return e-mail and destroy all copies of the original message.<br>
</font>
</body>
</html>