<div dir="ltr"><div><div>Hi Roman,<br></div>Take a look for registration package <code>elastix</code><br><a href="http://elastix.isi.uu.nl/">http://elastix.isi.uu.nl/</a><br></div>Regards, Denis Shamonin<br><div><br></div>
</div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Sep 20, 2013 at 2:36 PM, Dr. Roman Grothausmann <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:grothausmann.roman@mh-hannover.de" target="_blank">grothausmann.roman@mh-hannover.de</a>&gt;</span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Dear mailing list members,<br>
<br>
<br>
Searching through the itk and midas journal and google I found a lot of info and statements on how to register a 2D slice (from a 3D image, not a projection) to a 3D image (of different kind). However before I start to modify examples codes to suite our needs I wonder if there is already an application similar to itksnap for segementation, i.e. a registration CLI or GUI that let&#39;s one specify the two images, the metric, optimizer, multi-res-approach and desired transform and then does the job with appropriate ITK routines.<br>

<br>
Thanks for any help or hints<br>
Roman<br>
<br>
-- <br>
Dr. Roman Grothausmann<br>
<br>
Tomographie und Digitale Bildverarbeitung<br>
Tomography and Digital Image Analysis<br>
<br>
Institut für Funktionelle und Angewandte Anatomie, OE 4120<br>
Medizinische Hochschule Hannover<br>
Carl-Neuberg-Str. 1<br>
D-30625 Hannover<br>
<br>
Tel. <a href="tel:%2B49%20511%20532-9574" value="+495115329574" target="_blank">+49 511 532-9574</a><br>
______________________________<u></u>_______<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/<u></u>opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/<u></u>products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_<u></u>FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/<u></u>listinfo/insight-users</a><br>
</blockquote></div><br></div>