Dear Lee,<br>if you are really facing a memory issue one of the alternatives would be to downsample the input image.<br><br>The itk::ResmapleImageFilter will help you in this task.<br clear="all"><br>But before opting for this, you may want to go step by step and try to catch any exceptions you get.<br>
<br>There may well be other options.<br><br>
On the other hand, converting images to .vtk is not a required step for image processing purposes; you should be able to complete the entire image processing process within ITK. VTK is a useful and powerful tool used mainly for visualization purposes.<br>
<br>Kind regards,<br>JON HAITZ<br><br><br><br><div class="gmail_quote">On 23 March 2012 01:46, Lee Periolat <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:periolat@gmail.com">periolat@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
<br><div>Hello, I have been trying to use RegionGrowingSegmentation to perform region growing segmentation on some 3D Dicom images.  I was able to succeed on a small series of Dicom images by first transforming the DICOM series to a .vtk file using DicomSeriesReadWrite2.exe.  However, on a full series of DICOM images, RegionGrowingSegmentation crashes with a memory error.  (or at least I think I see a memory error appear in the console right before it dies).</div>

<div><br></div><div>Any ideas on how to overcome this?  I have been poking through the code to see if I can allocate more memory somewhere, but I can&#39;t find anything like that.</div><div><br></div><div>Thanks in advance,</div>

<div>Lee Periolat</div>
<br>_____________________________________<br>
Powered by <a href="http://www.kitware.com" target="_blank">www.kitware.com</a><br>
<br>
Visit other Kitware open-source projects at<br>
<a href="http://www.kitware.com/opensource/opensource.html" target="_blank">http://www.kitware.com/opensource/opensource.html</a><br>
<br>
Kitware offers ITK Training Courses, for more information visit:<br>
<a href="http://www.kitware.com/products/protraining.php" target="_blank">http://www.kitware.com/products/protraining.php</a><br>
<br>
Please keep messages on-topic and check the ITK FAQ at:<br>
<a href="http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ" target="_blank">http://www.itk.org/Wiki/ITK_FAQ</a><br>
<br>
Follow this link to subscribe/unsubscribe:<br>
<a href="http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users" target="_blank">http://www.itk.org/mailman/listinfo/insight-users</a><br>
<br></blockquote></div><br>