<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:14pt"><DIV><BR></DIV>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 12pt">
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV>Hi Luis,</DIV>
<DIV><BR>I have a MRI brain volume, i wanna to do that:<BR>1- Extract the Brain only from the volume.&nbsp;&nbsp;<BR>2- Segment Brain to Gray / <SPAN id=lw_1279207674_0 class=yshortcuts>White matter</SPAN>/ &nbsp;CFS.&nbsp; (may be tumor in the future will be considered)<BR>3- Output this segmented volume to FEM (Ansys) .&nbsp;&nbsp;<BR>Could you please let me know the shortcut to do that</DIV>
<DIV>Regards,</DIV>
<DIV>Yasser<BR><BR></DIV>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 14pt"><BR>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 12pt"><FONT size=2 face=Tahoma>
<HR SIZE=1>
<B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">From:</SPAN></B> Luis Ibanez &lt;luis.ibanez@kitware.com&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">To:</SPAN></B> yasser salman &lt;yass71@yahoo.com&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Cc:</SPAN></B> itk &lt;Insight-users@itk.org&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Sent:</SPAN></B> Sun, July 11, 2010 8:27:18 AM<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Subject:</SPAN></B> Re: [Insight-users] Mesh generation<BR></FONT><BR><BR>Hi Yasser,<BR><BR>Do you need something more detailed than Skull-removal ?<BR><BR>The first thing in MRI will be to evaluate whether<BR>you need bias-field correction or not.<BR><BR>Please provide more details on what you are trying to achieve.<BR><BR><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thanks<BR><BR><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Luis<BR><BR><BR>------------------------------------------------------------------------------<BR>
<DIV class=gmail_quote>On Sun, Jul 11, 2010 at 11:20 AM, yasser salman <SPAN dir=ltr>&lt;<A href="mailto:yass71@yahoo.com" rel=nofollow target=_blank ymailto="mailto:yass71@yahoo.com">yass71@yahoo.com</A>&gt;</SPAN> wrote:<BR>
<BLOCKQUOTE style="BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class=gmail_quote>
<DIV>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV>Hi Luis</DIV>
<DIV>&nbsp;</DIV>
<DIV>&nbsp;MRI</DIV>
<DIV>Yasser<BR></DIV>
<DIV class=hm></DIV>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 14pt">
<DIV class=hm><BR></DIV>
<DIV style="FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif; FONT-SIZE: 12pt">
<DIV class=hm><FONT size=2 face=Tahoma>
<HR SIZE=1>
<B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">From:</SPAN></B> Luis Ibanez &lt;<A href="mailto:luis.ibanez@kitware.com" rel=nofollow target=_blank ymailto="mailto:luis.ibanez@kitware.com">luis.ibanez@kitware.com</A>&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">To:</SPAN></B> yasser salman &lt;<A href="mailto:yass71@yahoo.com" rel=nofollow target=_blank ymailto="mailto:yass71@yahoo.com">yass71@yahoo.com</A>&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Cc:</SPAN></B> itk &lt;<A href="mailto:Insight-users@itk.org" rel=nofollow target=_blank ymailto="mailto:Insight-users@itk.org">Insight-users@itk.org</A>&gt;<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Sent:</SPAN></B> Sat, July 10, 2010 1:08:26 PM<BR><B><SPAN style="FONT-WEIGHT: bold">Subject:</SPAN></B> Re: [Insight-users] Mesh generation<BR></FONT></DIV>
<DIV>
<DIV></DIV>
<DIV class=h5><BR>&nbsp;Hi Yasser,<BR><BR>From what image modality ?<BR><BR><BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Luis<BR><BR><BR>----------------------------------------<BR>
<DIV class=gmail_quote>On Fri, Jul 9, 2010 at 6:43 PM, yasser salman <SPAN dir=ltr>&lt;<A href="mailto:yass71@yahoo.com" rel=nofollow target=_blank ymailto="mailto:yass71@yahoo.com">yass71@yahoo.com</A>&gt;</SPAN> wrote:<BR>
<BLOCKQUOTE style="BORDER-LEFT: rgb(204,204,204) 1px solid; MARGIN: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; PADDING-LEFT: 1ex" class=gmail_quote>Dear Luis,<BR>i asking for an easy way to segment /extract the whole brain from head,<BR>is it by using threshold tech., depending on histogram?<BR>Regards ,<BR><FONT color=#888888>Yasser<BR><BR><BR><BR></FONT></BLOCKQUOTE></DIV><BR></DIV></DIV></DIV></DIV></DIV><BR></DIV></BLOCKQUOTE></DIV><BR></DIV></DIV></DIV><BR></DIV></DIV></div><br>

      </body></html>