<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman,new york,times,serif;font-size:14pt"><div>Hello Everbody,<br><br><br>I have a problemn with interpreting deformation field shown by paraview plus some questions and I would be thankful if anybody can help.<br><br>- Does paraView only show .vtk files? I mean if I want to overlay deformation field with anatomical image I have to convert anatomical image to vtk format right? Is there any tool for that?<br><br>- I have tried paraview to visualize deformation field. Warped image (applying deformation field on moving image ) looks fine but when I view it in paraview using following this link:<br><br><span><a target="_blank" href="http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2008-June/026264.html">http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2008-June/026264.html</a></span><br><br>location if deformation does not look right! I have uploaded
 moving-image, fixed-image, deformation field (in vtk and mhd/raw formats) in addition to snapshot of what I see. To me, it is about 60 degree rotated:<br><br>(foo.tar.gz)<br><span><a target="_blank" href="http://www.4shared.com/file/193625658/15ff56f/footar.html">http://www.4shared.com/file/193625658/15ff56f/footar.html</a></span><br><br>Since the warped image looks fine, I think that my algorithm is working but I have a problem with interpreting what I see in paraview. Perhaps, I am missing something or doing something wrong in Paraview. I would be thankful if you can help.<br><br>Regards,<br><br><br>ps: the foo.tar.gz file contains the following files:<br>defSimulatedImg_15.vtk:&nbsp; deformation field in vtk format<br>defSimulatedImg_15.mhd/raw :&nbsp; defromation field in raw/mhd format.<br>resSimulatedImg_15.mhd/raw :&nbsp;&nbsp; warped images<br>SimulatedImg_15.mhd/raw : moving image<br>Template_1.mhd/mhd: fixed image<br>snapshot1.png :&nbsp;
 snapshot of what I see in paraview.<br><br><br><br></div>
<!-- cg16.c2.mail.ac4.yahoo.com compressed/chunked Sun Jan 10 13:17:09 PST 2010 -->
</div><br>

      </body></html>