<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">
<HTML>
<HEAD>
<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">
<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7654.12">
<TITLE>RE: [Insight-users] Problem implementing GradientAnisotropicDiffusionImageFilter</TITLE>
</HEAD>
<BODY>
<!-- Converted from text/plain format -->

<P><FONT SIZE=2>Hello Luis,<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; The pixel spacing is .2 mm.&nbsp;&nbsp; I did not SetSpacing in ITK code.&nbsp;&nbsp; Thanks for the insight.&nbsp;&nbsp; I will check that out.<BR>
<BR>
Regards,<BR>
&nbsp;&nbsp; Michael<BR>
<BR>
<BR>
-----Original Message-----<BR>
From: Luis Ibanez [<A HREF="mailto:luis.ibanez@kitware.com">mailto:luis.ibanez@kitware.com</A>]<BR>
Sent: Tue 12/1/2009 7:56 PM<BR>
To: O'Connor, Michael<BR>
Cc: Bill Lorensen; insight-users@itk.org<BR>
Subject: Re: [Insight-users] Problem implementing GradientAnisotropicDiffusionImageFilter<BR>
<BR>
Hi Michael,<BR>
<BR>
What is the pixel spacing of your image ?<BR>
<BR>
I believe that the ITK implementation may<BR>
be taking the pixel spacing into account<BR>
when using the value of conductance.<BR>
<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp; Please let us know,<BR>
<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Thanks<BR>
<BR>
<BR>
&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Luis<BR>
<BR>
<BR>
------------------------------------------------------------------<BR>
On Tue, Dec 1, 2009 at 5:17 PM, O'Connor, Michael<BR>
&lt;Michael.OConnor@umassmed.edu&gt; wrote:<BR>
&gt; Hi Bill,<BR>
&gt;     I use the exact same file with ITK (the one attached to the previous<BR>
&gt; email with MATLAB code).<BR>
&gt;<BR>
&gt; Regards,<BR>
&gt;    Michael<BR>
&gt;<BR>
&gt;<BR>
&gt; -----Original Message-----<BR>
&gt; From: Bill Lorensen [<A HREF="mailto:bill.lorensen@gmail.com">mailto:bill.lorensen@gmail.com</A>]<BR>
&gt; Sent: Tue 12/1/2009 4:17 PM<BR>
&gt; To: O'Connor, Michael<BR>
&gt; Cc: insight-users@itk.org<BR>
&gt; Subject: Re: [Insight-users] Problem implementing<BR>
&gt; GradientAnisotropicDiffusionImageFilter<BR>
&gt;<BR>
&gt; Can you provide a png file or meta file, or whatever file you tried with<BR>
&gt; itk?<BR>
&gt;<BR>
&gt; On Tue, Dec 1, 2009 at 4:08 PM, O'Connor, Michael<BR>
&gt; &lt;Michael.OConnor@umassmed.edu&gt; wrote:<BR>
&gt;&gt; Hi Bill,<BR>
&gt;&gt;     Thanks.   Attached is simple MATLAB test code  + the MATLAB filter<BR>
&gt;&gt; function used (Dr. Guy Gilboa's code).   I've also take the liberty of<BR>
&gt;&gt; attaching a test image (specifically opened in MATLAB code).   The test<BR>
&gt;&gt; image is 400x400 float with background = 0.024 + additive Gaussian Noise<BR>
&gt;&gt; and<BR>
&gt;&gt; foreground (circle) = 0.031 + additive Gaussian Noise.   As said<BR>
&gt;&gt; previously<BR>
&gt;&gt; MATLAB code seems to work as expected as shown in plot.   In ITK there is<BR>
&gt;&gt; no<BR>
&gt;&gt; similar intraregion filtering (i.e. filtered image ~ input )<BR>
&gt;&gt;<BR>
&gt;&gt; Regards,<BR>
&gt;&gt;    Michael<BR>
&gt;&gt;<BR>
<BR>
<BR>
</FONT>
</P>

</BODY>
</HTML>