<br>I&#39;m working with a very large dataset (1000&#39;s of 2D images, size &gt; 1024x1024 pixels, ushort RGB pixels).  A large portion of these images is background.<br><br>A few routines, like saving all the 2D images into a 3D volume, fail with segfaults due to malloc errors (on OSX 10.5.8 with 24Gb RAM; using ITK 3.16.0).<br>
<br>Is there an image format that provides &#39;sparse&#39; images?  This implies
there are no data values for some of the image pixels (is this the same
thing as transparent background?).<br>
<br>What is an optimal image format for working with this data?<br><br>Thanks in advance (TIA),<br>Darren<br><br>