<html><head><style type="text/css"><!-- DIV {margin:0px;} --></style></head><body><div style="font-family:times new roman, new york, times, serif;font-size:12pt"><DIV><BR></DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 12pt; FONT-FAMILY: times new roman, new york, times, serif">
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">Dear Luis and All:</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">&nbsp;</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">I am planing to apply some statistical model for CT liver segmenation. After some researches, I think I&nbsp;can&nbsp; use itk::ImagePCAShapeModelEstimator&nbsp; to get the average shape and feed the average shape to  itk::GeodesicActiveContourShapePriorLevelSetImageFilter. But I am still confused regarding the how to get the shape in commen space( maybe that is the registration problem)</DIV>
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<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">1 I have ten segmented livers from CT image, if the liver masks are in the same space, I understand I can get the signed distance map and then feed them to itk::ImagePCAShapeModelEstimator&nbsp;&nbsp; to get the average shape.</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">2 But how can I put the those binary mask in the same space? Should I register the grey level liver image or the binary mask to somewhere?</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">3 After I got the average shape, I also need to make the average shape and the new CT data in the same space? Can you please suggest me a way to do it? ( My feeling is that registering the different CT abodomi data is quite difficult. I tried to use rigid and affine registration tool provided by&nbsp;Daniel Rucker, it is hardly to see any registration effect for CT abodimi images of different person).</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">&nbsp;</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">&nbsp;</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">Thanks and my best regards</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">&nbsp;</DIV>
<DIV style="FONT-SIZE: 13px; FONT-FAMILY: arial, helvetica, sans-serif">Baoyun</DIV></DIV></div><br>

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