<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
<html>
<head>
  <meta content="text/html;charset=ISO-8859-1" http-equiv="Content-Type">
</head>
<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">
Hi Bert,<br>
<br>
I think you should add at the end of the for loop:
markerDilated-&gt;DisconnectPipeline(); <br>
<br>
Hope that helps<br>
Best<br>
Irene<br>
<br>
<br>
<br>
Bert wrote:
<blockquote
 cite="mid6f6eaba60804240957k516b1416u1d80cb7d51bd0602@mail.gmail.com"
 type="cite">Hi Luis,<br>
  <br>
Thanks a lot for your answer. What I am trying to do is to implement a
reconstruction algorithm. I haven't used any of the implemented ones
because I need to use my own structuring element.<br>
What I have to do is dilatation + intersection until the convergence,
this is why I need to modify the output of the Dilate filter. Is
possible to do it? This is the code I have:<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; InputImageType::Pointer marker = InputImageType::New();<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; InputImageType::Pointer markerDilated = InputImageType::New();<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; InputImageType::Pointer mask = InputImageType::New();<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; marker = readerMarker-&gt;GetOutput();&nbsp;&nbsp; //read the marker image<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; markerDilated = grayscaleReconstruction-&gt;GetOutput();&nbsp;&nbsp; //read
the dilated marker<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; mask = readerMask-&gt;GetOutput();&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; //read the mask image<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; // Next we create two iterators.&nbsp; The iterators are initialized
over the same region.&nbsp; <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; //The direction of iteration is set to 0, the $x$ dimension.<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; IteratorType markerDilatedIt( markerDilated,
markerDilated-&gt;GetRequestedRegion() );&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; IteratorType maskIt( mask, mask-&gt;GetRequestedRegion() );<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; markerDilatedIt.SetDirection(0);<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; maskIt.SetDirection(0);<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; grayscaleReconstruction-&gt;SetKernel( structuringElement );<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; WriterType::Pointer writerMarkerDilated = WriterType::New();<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; for (int i =0; i&lt;numberOfIterations; i++)<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; {<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; grayscaleReconstruction-&gt;SetInput( marker );&nbsp;&nbsp; <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; grayscaleReconstruction-&gt;Update();<br>
  <br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; for ( markerDilatedIt.GoToBegin(),&nbsp; maskIt.GoToBegin(); !
maskIt.IsAtEnd();<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; markerDilatedIt.NextLine(),&nbsp; maskIt.NextLine())<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; {<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; markerDilatedIt.GoToBeginOfLine();<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; maskIt.GoToBeginOfLine();<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; while ( ! markerDilatedIt.IsAtEndOfLine() )<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; {<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; if( maskIt.Get()==0 )<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; {<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; markerDilatedIt.Set( 0 );<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; ++markerDilatedIt;<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; ++maskIt;<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; else <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; {<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; ++markerDilatedIt;<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; ++maskIt;<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; writerMarkerDilated-&gt;SetFileName( argv[2] );&nbsp; //overwrite
the marker<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; writerMarkerDilated-&gt;SetInput(markerDilated);<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; writerMarkerDilated-&gt;Update();<br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; readerMarker-&gt;Update();<br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; marker-&gt;Update();<br>
  <br>
  <br>
&nbsp;&nbsp;&nbsp; }<br>
  <br>
Thanks a lot for your reply<br>
Best<br>
Bert<br>
  <br>
  <br>
  <pre wrap="">
<hr size="4" width="90%">
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</blockquote>
<br>
</body>
</html>